外蒙古包括今日蒙古国以及唐努乌梁海地区，蒙古国是国际社会广泛承认的独立主权国家，而唐努乌梁海地区则被俄罗斯控制。自辛亥革命清朝崩溃后，外蒙古实际处于半独立状态。1921年在苏联红军的介入下，中华民国政府尚能掌握内蒙古，而外蒙古地区成为不受管辖处于实质独立状态。外蒙古前后多次宣布独立，今蒙古国（1924年成立）获得中方确认，则是在二战末期之事，当时中华民国与苏联签订《中苏友好同盟条约》。

虽曾获得中华民国与中华人民共和国的承认，不过中华民国政府撤往台湾后于冷战期间曾有争议，冷战结束后则均已确认独立地位.

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王世杰回国称该条约可保中苏三十年的和平，于是8月24日立法院在孙科主持下，以95人赞成，4人反对（以起立方式表决）通过《中苏友好同盟条约》。

1946年1月5日，中华民国国民政府承认蒙古人民共和国独立^[50]。

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1952年10月13日，蒋中正在国民党的中央会议上，沉重地检讨说：“承认外蒙独立的决策，虽然是中央正式通过一致赞成的，但我本人愿负其全责。这是我个人的决策，是我的责任，亦是我的罪愆”。蒋还称，放弃外蒙古“实在是一个幼稚的幻想，绝非谋国之道”；

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中华民国政府2月23日宣布《中苏友好同盟条约》失效，从而推翻对蒙古人民共和国的独立承认。2月25日，外交部正式废除《中苏友好同盟条约》。^[53]

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1946年外蒙古等五国申请加入联合国，中华民国赞成，英国、美国反对，外蒙的入会要求被安理会否决^[56]，

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1955年12月13日，中华民国代表在安理会对联合国大会3502号草案中，蒙古人民共和国加入联合国的部分行使否决权，理由是全蒙古是中国的一部分。^{[61][62][63][64][65]}。

1961年10月25日，联合国安理会以9票赞成，0票反对，1票（美国）弃权的表决结果，通过了联合国安理会166号决议，建议联合国大会接受蒙古国加入联合国。中华民国未参加投票表决。10月27日，联合国大会通过第1630号决议案，接纳蒙古人民共和国加入联合国，中华民国未参加表决^[66][67]。

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2002年，中华民国外交部宣布中华民国重新承认蒙古国为一独立国家。^[73][74]自2002-2003年起，中华民国与蒙古国在双方的首都（台北与乌兰巴托）互设大使馆性质之代表处^[75][76]。在外交部网站的各国介绍中也加入了蒙古国^[77]。

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